Nghiên cứu căn nguyên, kết quả điều trị và xác định đường lây truyền của các chủng vi khuẩn đa kháng thuốc gây viêm phổi liên quan đến thở máy bằng kỹ thuật giải trình tự gen thế hệ mới

Abstract

1. Căn nguyên và đặc tính kháng kháng sinh của các chủng vi khuẩn gây viêm phổi liên quan thở máy

Căn nguyên gây viêm phổi liên quan thở máy gặp phổ biến là các vi khuẩn Gram âm, trong đó hàng đầu là A. baumanii, K. pneumonia và P. aeruginosa. Trong các vi khuẩn Gram dương, căn nguyên gặp nhiều nhất là S. aureus và cũng là căn nguyên thường gặp thứ 4. Ghi nhận sự đề kháng cao của các vi khuẩn với kháng sinh: > 80% các chủng A. baumanii, K. pneumoniae, P. aeruginosa đã kháng với gần như tất cả kháng sinh được thử, trừ colistin.

2. Kết quả điều trị bệnh nhân viêm phổi liên quan thở máy

Tỷ lệ bệnh nhân tử vong hoặc xin về để tử vong là 36,18%. Thời gian nằm viện tương đối dài, trung bình là 28,0 ± 18,0 ngày. Điều trị kháng sinh ban đầu phù hợp ở 41,18% nhóm tử vong và 70,00% nhóm sống nhưng khác biệt giữa 2 nhóm không có ý nghĩa thống kê.

3. Xác định nguồn lây truyền của các vi khuẩn đa kháng thuốc bằng kỹ thuật giải trình tự gen thế hệ mới

Xác định được một số Sequence Types (STs) nổi trội, đặc trưng riêng tại địa điểm nghiên cứu: ST2 (48%), ST571 (24%) của A. baumannii; ST15 (34%), ST16 (30%) của K. pneumoniae. Ghi nhận sự xuất hiện thường xuyên và các cụm lây truyền quy mô lớn, hầu hết có liên quan đến mẫu môi trường của A. baumannii (39 cụm lây truyền, liên quan từ 2 đến 22 chủng) và K. pneumoniae (37 cụm lây truyền, liên quan từ 2 đến 53 chủng). Tuy nhiên, E. coli chỉ xuất hiện ít và lây truyền hạn chế (11 cụm, liên quan từ 2 đến 6 chủng).